Marianne, die Tochter aus der liberalen Wiener Kaufmanns- und Fabrikantenfamilie von Maria und Josef Perger, heiratet mit 18 Jahren den Spinnereifabrikanten Michael Hainisch, bekommt zwei Kinder, von denen eines, Sohn Michael, der erste Bundespräsident der Ersten Republik wird. 

Mit den insbesondere für Arbeiterinnen notbringenden Folgen einer Rohstoffkrise in der Branche ihres Familienbetriebes konfrontiert, setzt sich Marianne Hainisch ab nun für die Erwerbsvoraussetzungen von Frauen ein – und die sieht sie in gleichberechtigten Bildungsmöglichkeiten. 1870 fordert sie Mädchengymnasien als Voraussetzung zum Hochschulstudium – es bedarf 22 Jahre ihres beharrlichen Einsatzes, bis tatsächlich das erste Mädchengymnasium in Wien-Mariahilf (Rahlgasse), es ist das erste im deutschsprachigen Raum, eröffnet wird. Aus privaten Mitteln gründet sie ein sechsklassiges Lyzeum, das 1891 Öffentlichkeitsrecht erhält. 1897 dürfen Frauen an der Universität Wien Philosophie studieren, zwei Jahre später Medizin (Karl Kraus setzt noch 1907 den Wunsch von Frauen, Medizin zu studieren, mit Hysterie gleich) und erst 20 Jahre später Jura. 

1902 schließt Hainisch die Frauenvereine zum Bund Österreichischer Frauenvereine zusammen (Vorsitzende bis 1918), 1909 wird sie zur Vizepräsidentin des Frauenweltbundes gewählt. Bis zum 1. Weltkrieg arbeitet sie für die Fürsorge und die Friedensbewegung zusammen mit Bertha von Suttner, nach deren Tod 1914 sie die Leitung der Friedenskommission im Bund Österreichischer Frauenvereine übernimmt. 1924 initiiert sie nach amerikanischem Vorbild die Einführung des Muttertags in Österreich. Gewohnt hat Marianne Hainisch in der ­Rochusgasse 7 im 3. Bezirk.